Сотрудничество с ведущими центрами академической, музейной и университетской науки, со специалистами в области славяно-финской и архитектурной археологии – залог развития археологического направления в деятельности МУРИ. В 1998–2004 гг. старший научный сотрудник музея А.В. Семенов обучался на Кафедре археологии СПбГУ. Его дипломная работа «Археологические памятники Извары и ее окрестностей в контексте археологии Ижорского плато», напрямую связанная с программой развития музея и его практической деятельностью, получила высокую оценку специалистов и была рекомендована к публикации.
Началом следующего этапа полевых исследований стало случайное открытие фундамента господского дома первой половины XVIII века в 2002 году, при инженерных работах у западного крыла усадьбы. По инициативе музея были начаты раскопки, которые любезно согласился возглавить В.И. Кильдюшевский (ИИМК РАН). В 2002 г. в 13 шурфах были выявлены остатки валунного фундамента, сложенного насухо, и остатки большой изразцовой печи. На следующий год раскопки были продолжены. Размеры вскрытой части дома составили 15х26 м. Эта неизвестная ранее постройка, вероятно, являлась первым господским домом усадьбы, построенным в первой половине – середине XVIII в., и разобранного на один уровень перед строительством нового. В результате исследований 2003 г. удалось установить:
1. Исследуемый фундамент уходит под ныне существующее здание, постройки второй половины XVIII века, а следовательно, дом, стоявший на нем, был построен ранее – в первой половине – середине XVIII в.
2. Строительство нового дома началось сразу же после разборки предыдущего, о чем свидетельствует положение нижней дорожки в южной стенке шурфа 15 непосредственно на линзе раствора и строительного мусора, появившейся в результате разборки дома.
3. Судя по обилию фрагментов оконного стекла в квадратах 7, 6, 14 и 2, южная стена здания была застеклена и, возможно представляла собой застекленную веранду или галерею вдоль всего южного фасада дома. Во время раскопок собрана небольшая коллекция находок XVIII-XIX вв.
В результате работ 2002–2003 гг. была осознана значимость археологии для изучения эволюции всего усадебного комплекса. В долгосрочную программу развития Музея-усадьбы Н.К. Рериха входит реконструкция облика усадьбы на конец XIX в., а также изучение строительной истории усадьбы в XVII-XIX вв. Для этого необходимо наряду с архивным поиском вести планомерные археологические исследования.
Материалы раскопок 2002–2003 гг. представлены ныне в экспозиции, посвященной истории Извары.
В 2005–2007 гг. под руководством А.В. Семенова на территории усадебного парка производились разведочные раскопки (рис. 8). Исследованию подверглись остатки архитектурных сооружений второй половины XVIII – первой половины XX вв., в переотложенном слое встречено небольшое количество позднесредневековой керамики. Параллельно производились разведки на территории Волосовского района (рис. 9).
Главной задачей археологических исследований 2008 года, произведенных А.В. Семеновым и автором данной статьи, стало определение характеристик культурного слоя на территории усадьбы. Если ранее объектом изучения были в первую очередь архитектурные сооружения XVIII – XX вв., то теперь особое место занял вопрос о наличии и сохранности в Изваре поселенческих слоев эпохи средневековья. Основанием для того, чтобы предполагать их наличие, было упоминание деревни Взвар Покровского Озерецкого погоста в Писцовой книге Вотской пятины 1500 года, обозначение Извары на картах XVII – начала XVIII вв., а также разрозненные находки фрагментов средневековой керамики и находка в 1993 году ромбощиткового височного кольца.